Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP17L4A6NCW7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms