Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYCE3A1L190 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE3A1L190 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms