Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
A0A0U1RRA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
A0A0U1RRA0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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