Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0D9SFI3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0D9SFI3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms