Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
BPTFQ12830 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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