Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NELL1-201ENST00000298925 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139274.2-201ENST00000606274 4127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF13-201ENST00000344229 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PNMA8A-201ENST00000313683 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-204ENST00000395980 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TGOLN2-201ENST00000282120 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00346-201ENST00000538077 6265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512383.1-201ENST00000624175 2677 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKBP1-201ENST00000456763 7158 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL772363.1-201ENST00000371390 3222 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms