Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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BRD3Q15059 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
BRD3Q15059 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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