Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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GTF2H3Q13889 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF2H3Q13889 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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