Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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GPS1Q13098 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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