Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MILR1-202ENST00000612535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN16-201ENST00000264734 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEPDC5-202ENST00000382112 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA8B-201ENST00000342314 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008985.1-201ENST00000624169 2239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591848.3-201ENST00000570141 2968 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRIK3-201ENST00000373091 9101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRB10-204ENST00000398812 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASTN1-202ENST00000361833 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD7-201ENST00000298542 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GALC-203ENST00000393569 2547 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC4H2-203ENST00000447788 2649 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTR2-201ENST00000260641 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 DCTN4-203ENST00000447998 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110079.1-201ENST00000567913 4395 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025822.2-201ENST00000455199 2287 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM22-201ENST00000199814 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 UHRF2P1-201ENST00000431339 2387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms