Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB4-202ENST00000615384 4725 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NIM1K-204ENST00000512796 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-204ENST00000392003 3464 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GMEB2-202ENST00000370069 4011 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 USP17L15-202ENST00000621432 1680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TGM5-205ENST00000610827 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APLF-201ENST00000303795 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EDNRA-202ENST00000358556 3823 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF165-201ENST00000269439 7596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COX19-201ENST00000344111 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6C-202ENST00000415905 4172 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM215-201ENST00000342743 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL6-205ENST00000433608 2548 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1E-203ENST00000360108 6970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD2-202ENST00000409014 3404 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4E2-202ENST00000409098 3448 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP112-203ENST00000535342 3392 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD9B-203ENST00000409246 2794 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms