Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SMCO1Q147U7 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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