Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ARL2-SNX15V9GYD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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