Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYVE1Q9Y5Y7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms