Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF6Q9Y252 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms