Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
L1RE1Q9UN81 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms