Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
USP18Q9UMW8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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