Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRPF3Q9ULD4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms