Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms