Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TNIKQ9UKE5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TNIKQ9UKE5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TNIKQ9UKE5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms