Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SALL4Q9UJQ4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms