Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIMS3Q9UJD0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms