Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATPIF1Q9UII2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms