Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPA4Q9UI42 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms