Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCF2Q9UG63 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF2Q9UG63 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms