Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VTI1BQ9UEU0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VTI1BQ9UEU0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms