Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPP1R1BQ9UD71 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R1BQ9UD71 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms