Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM8A1Q9UBU6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms