Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD2Q9UBB5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms