Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MIS18AQ9NYP9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MIS18AQ9NYP9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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