Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHCHD3Q9NX63 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHCHD3Q9NX63 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms