Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf109Q9NX04 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C1orf109Q9NX04 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C1orf109Q9NX04 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms