Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCM2LQ9NUG4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCM2LQ9NUG4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms