Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM7SF3Q9NS93 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms