Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP4Q9NRJ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms