Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLE3Q9NRF9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POLE3Q9NRF9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms