Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDM10Q9NQV6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM10Q9NQV6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms