Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A4GALTQ9NPC4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A4GALTQ9NPC4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms