Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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USP29Q9HBJ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP29Q9HBJ7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP29Q9HBJ7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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USP29Q9HBJ7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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USP29Q9HBJ7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP29Q9HBJ7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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