Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms