Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDCL3Q9H2J4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms