Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LHX5Q9H2C1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LHX5Q9H2C1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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