Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTR3CQ9C0K3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTR3CQ9C0K3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms