Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXQ1Q9C009 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXQ1Q9C009 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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