Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM8Q9BZR9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM8Q9BZR9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms