Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NIFKQ9BYG3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms