Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms