Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CARD11Q9BXL7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARD11Q9BXL7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms