Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS2Q9BVG9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms