Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA3Q9BTC8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTA3Q9BTC8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms